فهم الفيروس التاجي و COVID-19 على المستوى الجيني

Published on 
July 21, 2020
Categories: 

CHLA-COVID19-Research-Bard-1200x628-01.jpg

PhD  و Xiaowu Gai, PhD، قسم علم الأمراض والطب المخبري

كان المرضى من مختلف الأعمار والأعراق ، و المواقع الجغرافية المختلفة ، يظهرون أنواعًا مختلفة من المرض وشدة الأعراض بسبب COVID-19. في حين كان يُعتقد في البداية أن الأطفال أقل تأثراً بالمرض من البالغين ، إلا أنه يمكنهم التعافي من العدوى الأولية فقط ليعانيوا لاحقًا من أعراض الالتهاب المعروفة باسم متلازمة الالتهابات المتعددة في الأطفال (MIS-C)، مع أعراض مشابهة غالبًا لمرض كاواساكي. في الولايات المتحدة ، تحدث معدلات العدوى والوفيات غير المتكافئة في الأمريكيين الأفارقة مقارنة بالأعراق الأخرى. في جميع أنحاء العالم ، أبلغت بعض البلدان (مثل إيطاليا وإسبانيا) أيضًا عن معدلات وفيات أعلى بكثير مقارنة بغيرها (مثل كوريا الجنوبية والصين). هذا على خلفية التقارير المتعددة التي توثق الطفرات المتكررة في جينوم SARS-CoV-2  ، الفيروس الذي يسبب COVID-19. تسلط هذه الملاحظات معًا الضوء على الحاجة إلى علم الأوبئة الجينومية التفصيلية ودراسات استجابة المضيف لـ SARS-CoV-2 عبر مجموعة واسعة من المرضى من مختلف الأعمار والجنس والعرق والوضع الاقتصادي والموقع الجغرافي. 

طورت Jennifer Dien Bard, PhD و Jennifer Dien Bard, PhD ، وزملائهم في مركز الطب الشخصي ومختبر الفيروسات السريرية التابع  لقسم علم الأمراض والطب المخبري في مستشفىChildren’s Hospital Los Angeles  مؤخرًا أدوات تسلسل الجينوم الفيروسي والمعلوماتية الحيوية لدراسة تطور وبائيات COVID-19 وتتبع أصول السلالات وترابط الالتهابات. كما طوروا أيضاً واجهة على شبكة الإنترنت للاستعلام من قاعدة البيانات للتسلسلات التي تم جمعها وإجراء التحليل الجيني للسلالات على الإنترنت. أهدافهم هي تحليل الجينوم الفيروسي من عينات إيجابية داخل لوس أنجلوس وفي جميع أنحاء الولايات المتحدة لتحديد ارتباطها المحتمل داخل المجتمعات المختلفة وعبرها. يهدف الفريق أيضًا إلى: 

اكتشاف الارتباطات بين الفيروس والعمر والجنس والعرق والعوامل الوراثية وشدة المرض والنتائج السريرية. يمكن أن يحدد هذا كيفية تفاعل الفيروس مع أشخاص مختلفين للتأثير على مسار المرض.

تحديد ما إذا كانت طفرات كورونا فيروس تؤثر على الاستجابة المناعية للشخص ، كما هو معروف للفيروسات الأخرى مثل فيروس نقص المناعة البشرية HIV .

تطوير الاختبارات السريرية لتشخيص الالتهابات مع أنواع فرعية مختلفة من فيروس كورونا والتنبؤ بخطر إصابة المريض على أساس العوامل الوراثية.

وقد مُنح دكتور Gai أيضًا تمويلًا بحثيًا للتحقيق في الجوانب الأخرى للتفاعل بين كورونا فيروس وأولئك الذي يتم إصابتهم. بعض الأفراد أثبتت إصابتهم موجبة بالفيروس حتى بعد الشفاء التام. سوف يستكشف دكتور Gai الأسباب المحتملة لذلك، والتي تشمل واحدًا أو أكثر مما يلي:

 شظايا المواد الوراثية الفيروسية ، بدلاً من العدوى النشطة

 سلالات فيروسية جديدة أدت إلى استمرار الالتهابات

 الجينات التي تؤهب الأفراد وتعرضهم لخطر أعلى للإصابة بالعدوى أو نقص المناعة

باستخدام تسلسل الجينوم لفحص الجينات الوراثية لكل من الفيروس والمرضى ، يهدف دكتور Gai إلى فك رموز التفاعلات بين الفيروس والأفراد الذين يصابون بالعدوى وفحص العوامل المناعية التي قد تطيل العدوى.